信行禪师，於教乘立二阶，就根机立叁阶。教乘之二阶者，即一乘教与叁乘教也。

五教章上曰：

后代信行禪师依此宗立二教，谓一乘叁乘。叁乘者即别解别行及叁乘差别，并先习小乘后趣大乘是也。一乘者谓普解普行，唯是一乘，亦华严法门及直进等是也。

根机之叁阶者，谓最上利根一乘之机為第一阶，利根而有正见之叁乘机為第二阶，利根或住於空见或住於有见而不化诸佛，不度诸法者，又钝根之无惭无愧，造五逆十恶者，為第叁阶。佛灭后一千年已前為第一阶第二阶之机类，而一千年后惟為第叁阶之机类，第一阶第二阶之眾生，成就正见而无爱憎，故一乘叁乘，各学别法，则解脱生死获得菩提，而第叁阶之机，成就我见边见，故偏学一乘，偏学叁乘或偏念弥陀，偏念法华，爱此憎彼，非彼是此，因成诽谤罪，堕於深坑而无出离之期。故佛开普真普正之佛法，以化第叁阶之人。病药相当，治道无违，法不分大小，人不辨凡圣，普信普归，名為普法。若如斯不堕於爱憎，能离毁谤，则菩提涅槃在近矣。叁阶佛法之大要如此。着书有叁十五部四十四卷。见群疑论探要记六。说中自存至理，然因之至谓念佛读经等，為所谓别法，今日修之。為增长我见之堕狱业因，其弊有不堪者，故当时禁其传播，毁其撰集。歷代叁宝记曰：

费长房录中初列信行撰述，而后同二十年判断不听流行。

开元释教录十八曰：

开皇二十年有勅禁断，不听传行，而其徒既眾蔓延弥广。既以信行為教主别行异法，似同天授立邪叁宝，乃至开元十叁年乙丑岁六月叁日勅诸寺叁阶院并令除去。