消除眼等六根，无始以来之罪垢，以无量之功德庄严之，使之清净洁白也。由此清净之功德而六根各发无碍之妙用，且得六根互用之自在也。

法华经法师功德品曰：

若善男子善女人，受持是法华经，若读若诵，若解说，若书写，是人当得八百眼功德，千二百耳功德，八百鼻功德，千二百舌功德，八百身功德，千二百意功德。以是功德庄严，六根皆令清净。(中略)父母所生清净肉眼，见於叁千大千世界内外所有山林河海，下至阿鼻地狱，上至有顶。亦见其中一切眾生及业因缘果报生处，悉见悉知。(中略)以是清净意根乃至闻一偈一句，通达无量无边之义。

(经中具说六根，今举初后之二根)。普贤观经曰：

乐得六根清净者，当学是观。

圆觉经曰：

心清净，眼根清净，耳根清净，鼻舌身意復如是。

知度论十一曰：

布施时，六根清净善欲心生。